COVID-19病者的表现可以从无症状携带、轻症到须要呼吸机甚至体外表皮肺氧合(ECMO)维持生命的危急诊病征,这其中所的关键决定病态因素依然有待密码。同时,新型冠状菌株是否在传递过程中所起因轻微的基因突变,导致菌株毒力和传染病态的彻底改变,也急需全面分析。
自SARS爆发之后,复旦大学附属北京市王为共卫生病理中所心(以下简称王为卫中所心)与转化针灸国际组织重大科技王为共设施(北京)(以下简称设施)、北京儿科分析所、针灸免疫学国际组织重点分析小组、瑞金医院病理菌株学分析小组,复旦大学北京法学院化学键菌株分析小组、北京交通大学法学院附属同仁医院、国际组织科委植物内分泌生态系统分析所、北京伯特兰分析所和北京微量元素与健康分析所等其他部门合力,就新型冠状菌株测序、化学键病理不同之处、传染病病理不同之处完成了深入分析。
5年末20日,《Nature》杂志发表了这一小组的最新分析结果。值得注意,王为卫生中所心卢洪洲大学教授与设施处长陈赛娟博士生授命的联合攻关小组,收集了王为卫中所心在2020年1年末20日-2年末25日期间收治的326实有病征标本,对菌株测序基因突变、病态传染病不同之处和免疫反应彻底改变等资料完成了全面深度分析。
分析小组不断进步技术方法,高质量完成了112实有新冠菌株测序测序、组装和解析。他们基于菌株测序核酸的进化树分析推断出,新冠菌株主要有两个分支(Clade I 和Clade II)。已确认有华南海产市场触及历史学者的6实有病征均密集在其中所一个分枝中所(Clade I),而Clade II病征无该触及历史学者,提示COVID-19SARS的起因并不受到限制华南海产市场。
新冠菌株测序进化树
接着,通过对SARS随之而来的显然相同时间阶段和显然相同范围病征的新冠菌株基因核酸(截至2020年3年末初)基因突变不同之处的更为分析,从北京病实有复合的菌株测序中所识别了169个碱基彻底改变,其减法再次出现的突变与已王为布的菌株核酸相符,展现较为安定的进化过程,提示该菌株可能会在SARS早期就已适应在人类寄生虫中所传递。同时他们推断出, 新冠菌株两个分支的传递病态、致病病态和病态传染病等方面无显着相似之处,未推断出与COVID-19急诊病征有显着涉及的菌株基因突变核酸。
COVID-19病者淋巴细胞变化
分析管理人员从病理和药理学分析推断出,COVID-19病征淋巴细胞轻微减少,尤其是急诊病征CD4+和CD8+ T细胞呈显着完成病态降低近来,且炎病态细胞因子IL-6和IL-8轻微增高。COVID-19传染病拓展严重程度的密切涉及主要与病征年龄、基础传染病及淋巴细胞减少和涉及的细胞因子风暴众所周知,为传染病向急诊起因变化的关键预警因子。
这一分析结果意义深远,对于全面认清新型冠状菌株的化学键流行病不同之处、传染病起因拓展功能病态,为急诊病者早期诊断和治疗,以及为药物和疫苗开发设计构建了重要的参考依据。
此外,分析小组还向中所华人民共和国国际组织组学资料百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) ()、全球流感核酸资料库(GISAID)和NCBI的国际病态核酸资料库(SRA)递交了112个病实有的新冠菌株测序高质量核酸资料。同时,设施也搭建了重大传染病大资料该平台新冠菌株测序资料交互式、开源在线分析博客()。国外科研其他部门和科学研究都可显然构建涉及分析资料。
早期记事:
Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020
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